Kompaktlampen haben trotz ihrer vielen Vorteile auch einige Nachteile, die bei der Planung einer Terrarienbeleuchtung berücksichtigt werden sollten. Der wichtigste Punkt ist, dass die UV-Strahlung nur auf kurze Distanz wirksam ist. Damit Tiere tatsächlich genügend UV erhalten, müssen Kompaktlampen im Terrarium drin montiert werden, sodass der Abstand zur Lichtquelle gering bleibt. Eine Montage ausserhalb oder oben über dem Gitter führt meist zu deutlich reduzierten UV-Werten, was für viele Reptilien unzureichend ist.

Hinzu kommt, dass Kompaktlampen kaum Wärme abgeben. Dies kann zwar in kleinen Terrarien ein Vorteil sein, wird aber zum Nachteil, wenn das Terrarium zusätzlich beheizt werden muss. Für die Schaffung eines Sonnenplatzes oder einer gezielten Wärmezufuhr eignen sie sich praktisch nicht, sodass immer eine zusätzliche Wärmequelle notwendig ist. Auch als alleinige Hauptbeleuchtung sind sie in den meisten Fällen ungeeignet, da sie nur eine lokale Lichtquelle darstellen und grössere Terrarien nicht gleichmässig ausleuchten können.

Ein weiterer Nachteil ist, dass Kompaktlampen im Vergleich zu leistungsstärkeren Systemen wie Metalldampflampen oder LED-Röhren nur begrenzt Lichtintensität bieten und daher oft als Ergänzung statt als Hauptlicht genutzt werden. Auch die Lebensdauer und UV-Stabilität variiert je nach Modell, weshalb regelmässige Kontrolle und gelegentlich ein früher Austausch erforderlich sind. Insgesamt sind Kompaktlampen nützlich, aber meist nur als Teil eines kombinierten Beleuchtungskonzepts wirklich ideal.